MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 4705

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017778	ACA	2	6	8	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017778	ATAA	2	8	62	69	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017778	TAA	2	6	72	77	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017778	AAT	2	6	82	87	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017778	TTA	2	6	91	96	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017778	CT	3	6	187	192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017778	CA	3	6	236	241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017778	A	7	7	268	274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017778	ATT	2	6	281	286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017778	AT	3	6	307	312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017778	T	6	6	347	352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017778	CAT	2	6	361	366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017778	AT	3	6	365	370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017778	ATT	2	6	379	384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017778	T	6	6	387	392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017778	ATTTT	2	10	432	441	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017778	T	6	6	438	443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017778	A	7	7	452	458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017778	A	6	6	462	467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017778	AAAT	2	8	492	499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017778	TAA	3	9	518	526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017778	AC	3	6	555	560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017778	A	6	6	563	568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017778	CA	3	6	611	616	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017778	A	6	6	651	656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017778	CTTC	2	8	664	671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017778	ACAAT	2	10	694	703	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017778	CAT	2	6	712	717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017778	ATT	2	6	741	746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017778	TAT	2	6	765	770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017778	TCAAT	2	10	774	783	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017778	ATTT	2	8	789	796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017778	AATT	2	8	821	828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017778	T	8	8	860	867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017778	ATT	2	6	932	937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017778	A	6	6	942	947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017778	CTAT	2	8	948	955	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017778	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017778	ATC	2	6	988	993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017778	AAC	2	6	1014	1019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017778	A	6	6	1026	1031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017778	TA	3	6	1048	1053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017778	AT	3	6	1064	1069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017778	AATTAC	2	12	1104	1115	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017778	TAATA	2	10	1119	1128	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017778	TA	4	8	1158	1165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017778	TAT	2	6	1173	1178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017778	ATA	2	6	1189	1194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017778	TAC	2	6	1198	1203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017778	ATTTC	2	10	1341	1350	20 %	60 %	0 %	20 %	386859045
51	NC_017778	TTTTG	2	10	1370	1379	0 %	80 %	20 %	0 %	386859045
52	NC_017778	TA	4	8	1393	1400	50 %	50 %	0 %	0 %	386859045
53	NC_017778	TTG	2	6	1407	1412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859045
54	NC_017778	TC	4	8	1457	1464	0 %	50 %	0 %	50 %	386859045
55	NC_017778	CTT	2	6	1494	1499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859045
56	NC_017778	TAGCTT	2	12	1500	1511	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386859045
57	NC_017778	GTTT	2	8	1547	1554	0 %	75 %	25 %	0 %	386859045
58	NC_017778	ATA	2	6	1563	1568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859045
59	NC_017778	TA	3	6	1567	1572	50 %	50 %	0 %	0 %	386859045
60	NC_017778	TTA	2	6	1574	1579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859045
61	NC_017778	TA	3	6	1578	1583	50 %	50 %	0 %	0 %	386859045
62	NC_017778	TCT	2	6	1667	1672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859045
63	NC_017778	AAT	2	6	1676	1681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859045
64	NC_017778	TTC	2	6	1699	1704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859045
65	NC_017778	AAT	2	6	1716	1721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859045
66	NC_017778	TCT	2	6	1733	1738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859045
67	NC_017778	CTA	2	6	1743	1748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859045
68	NC_017778	ATTGC	2	10	1826	1835	20 %	40 %	20 %	20 %	386859045
69	NC_017778	CAC	2	6	1857	1862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859045
70	NC_017778	TC	3	6	1863	1868	0 %	50 %	0 %	50 %	386859045
71	NC_017778	ATG	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859045
72	NC_017778	TTTTTG	2	12	1972	1983	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386859045
73	NC_017778	TCT	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859045
74	NC_017778	TGT	2	6	2008	2013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859045
75	NC_017778	TAA	2	6	2017	2022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859045
76	NC_017778	ACA	2	6	2024	2029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859045
77	NC_017778	AAG	2	6	2047	2052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859045
78	NC_017778	CAT	2	6	2055	2060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859045
79	NC_017778	T	7	7	2060	2066	0 %	100 %	0 %	0 %	386859045
80	NC_017778	CAT	2	6	2121	2126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859045
81	NC_017778	ATC	2	6	2146	2151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859045
82	NC_017778	ATA	2	6	2154	2159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859045
83	NC_017778	TAG	2	6	2199	2204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859045
84	NC_017778	T	7	7	2211	2217	0 %	100 %	0 %	0 %	386859045
85	NC_017778	T	6	6	2229	2234	0 %	100 %	0 %	0 %	386859045
86	NC_017778	TAG	2	6	2238	2243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859045
87	NC_017778	A	6	6	2362	2367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017778	TC	3	6	2408	2413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017778	A	7	7	2464	2470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017778	ATATTA	2	12	2522	2533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017778	AC	4	8	2558	2565	50 %	0 %	0 %	50 %	386859046
92	NC_017778	CAA	2	6	2605	2610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859046
93	NC_017778	GGA	2	6	2640	2645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386859046
94	NC_017778	AAT	2	6	2659	2664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859046
95	NC_017778	TC	3	6	2760	2765	0 %	50 %	0 %	50 %	386859046
96	NC_017778	AT	3	6	2775	2780	50 %	50 %	0 %	0 %	386859046
97	NC_017778	TTC	2	6	2840	2845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859046
98	NC_017778	A	7	7	2933	2939	100 %	0 %	0 %	0 %	386859046
99	NC_017778	TCA	2	6	2955	2960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859046
100	NC_017778	T	6	6	3006	3011	0 %	100 %	0 %	0 %	386859046
101	NC_017778	AATT	2	8	3139	3146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017778	TAA	2	6	3153	3158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017778	ATT	2	6	3168	3173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017778	T	6	6	3207	3212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017778	A	6	6	3229	3234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017778	TAAAAA	2	12	3290	3301	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017778	AAT	2	6	3304	3309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017778	TCA	2	6	3375	3380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017778	AGC	2	6	3381	3386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017778	ACCAT	2	10	3407	3416	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_017778	AT	3	6	3436	3441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017778	T	6	6	3454	3459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017778	CTT	2	6	3470	3475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017778	AG	3	6	3488	3493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017778	AAG	2	6	3505	3510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017778	ATA	2	6	3538	3543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017778	T	7	7	3560	3566	0 %	100 %	0 %	0 %	386859047
118	NC_017778	CT	3	6	3578	3583	0 %	50 %	0 %	50 %	386859047
119	NC_017778	TAA	2	6	3606	3611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859047
120	NC_017778	TTC	2	6	3613	3618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859047
121	NC_017778	TCTT	3	12	3623	3634	0 %	75 %	0 %	25 %	386859047
122	NC_017778	AGA	2	6	3655	3660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859047
123	NC_017778	ATT	2	6	3724	3729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859047
124	NC_017778	T	6	6	3761	3766	0 %	100 %	0 %	0 %	386859047
125	NC_017778	CTT	2	6	3783	3788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859047
126	NC_017778	A	7	7	3811	3817	100 %	0 %	0 %	0 %	386859047
127	NC_017778	ATATCA	2	12	3869	3880	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386859047
128	NC_017778	TTTC	2	8	3881	3888	0 %	75 %	0 %	25 %	386859047
129	NC_017778	CCT	2	6	4068	4073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859047
130	NC_017778	AATT	2	8	4075	4082	50 %	50 %	0 %	0 %	386859047
131	NC_017778	TCA	2	6	4118	4123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859047
132	NC_017778	TCA	2	6	4148	4153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859047
133	NC_017778	TCT	2	6	4169	4174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859047
134	NC_017778	TTG	2	6	4285	4290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859047
135	NC_017778	CCCT	2	8	4306	4313	0 %	25 %	0 %	75 %	386859047
136	NC_017778	TCT	2	6	4331	4336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859047
137	NC_017778	TAT	2	6	4374	4379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859047
138	NC_017778	ATA	2	6	4482	4487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859047
139	NC_017778	TTC	2	6	4496	4501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859047
140	NC_017778	CCT	2	6	4509	4514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_017778	ATT	2	6	4525	4530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017778	AATAA	2	10	4554	4563	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017778	TA	3	6	4575	4580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017778	AAAT	2	8	4601	4608	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017778	ATT	2	6	4616	4621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017778	A	6	6	4647	4652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017778	AAT	2	6	4661	4666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017778	ATA	3	9	4684	4692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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